MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 134128

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_019738	AAT	2	6	227931	227936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308565
4002	NC_019738	AAT	2	6	227964	227969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308565
4003	NC_019738	CCA	2	6	227996	228001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308565
4004	NC_019738	TTG	2	6	228006	228011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308565
4005	NC_019738	ACA	2	6	228103	228108	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308565
4006	NC_019738	GGTT	2	8	228144	228151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_019738	TGG	2	6	228222	228227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4008	NC_019738	AGG	2	6	228237	228242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_019738	AGG	2	6	228244	228249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_019738	CATC	2	8	228379	228386	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_019738	AGTC	2	8	228400	228407	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4012	NC_019738	AGCT	2	8	228453	228460	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4013	NC_019738	ACA	2	6	228514	228519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308566
4014	NC_019738	GTG	2	6	228532	228537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308566
4015	NC_019738	T	6	6	228720	228725	0 %	100 %	0 %	0 %	428308566
4016	NC_019738	TGGC	2	8	228770	228777	0 %	25 %	50 %	25 %	428308566
4017	NC_019738	CGC	2	6	228779	228784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308566
4018	NC_019738	TTAA	2	8	228907	228914	50 %	50 %	0 %	0 %	428308566
4019	NC_019738	TCA	2	6	228983	228988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308566
4020	NC_019738	CCTT	2	8	229045	229052	0 %	50 %	0 %	50 %	428308566
4021	NC_019738	ATC	2	6	229104	229109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308566
4022	NC_019738	T	6	6	229122	229127	0 %	100 %	0 %	0 %	428308566
4023	NC_019738	ATC	2	6	229173	229178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308566
4024	NC_019738	ATA	2	6	229218	229223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308566
4025	NC_019738	TTG	2	6	229309	229314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308566
4026	NC_019738	ATAG	2	8	229324	229331	50 %	25 %	25 %	0 %	428308566
4027	NC_019738	TTG	2	6	229393	229398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308566
4028	NC_019738	TCA	2	6	229507	229512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308566
4029	NC_019738	CTTG	2	8	229517	229524	0 %	50 %	25 %	25 %	428308566
4030	NC_019738	GGT	2	6	229611	229616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308566
4031	NC_019738	TCC	2	6	229617	229622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308566
4032	NC_019738	TC	3	6	229740	229745	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_019738	GAT	2	6	229811	229816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_019738	ATT	2	6	229880	229885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_019738	GAGG	2	8	229900	229907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_019738	ACA	2	6	229941	229946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_019738	ACT	2	6	230095	230100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4038	NC_019738	CTT	2	6	230109	230114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_019738	TGGT	2	8	230200	230207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_019738	TTG	2	6	230261	230266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_019738	GAA	2	6	230313	230318	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_019738	TC	3	6	230327	230332	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_019738	GGA	2	6	230367	230372	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_019738	TAC	2	6	230377	230382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_019738	GAG	2	6	230383	230388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_019738	TAAA	2	8	230499	230506	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4047	NC_019738	AGA	2	6	230509	230514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_019738	TGA	2	6	230522	230527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308567
4049	NC_019738	AAG	2	6	230541	230546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308567
4050	NC_019738	CAG	2	6	230651	230656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308567
4051	NC_019738	AGA	2	6	230670	230675	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308567
4052	NC_019738	CCAA	2	8	230723	230730	50 %	0 %	0 %	50 %	428308567
4053	NC_019738	CAG	2	6	230822	230827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308567
4054	NC_019738	GGA	2	6	230883	230888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308567
4055	NC_019738	CAG	2	6	230905	230910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308567
4056	NC_019738	AC	3	6	230934	230939	50 %	0 %	0 %	50 %	428308567
4057	NC_019738	ATT	2	6	230942	230947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308567
4058	NC_019738	TGGG	2	8	230959	230966	0 %	25 %	75 %	0 %	428308567
4059	NC_019738	TACC	2	8	231006	231013	25 %	25 %	0 %	50 %	428308567
4060	NC_019738	CAT	2	6	231183	231188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308567
4061	NC_019738	AGC	2	6	231234	231239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308567
4062	NC_019738	GCC	2	6	231244	231249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308567
4063	NC_019738	TCT	2	6	231278	231283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308567
4064	NC_019738	GTCA	2	8	231338	231345	25 %	25 %	25 %	25 %	428308567
4065	NC_019738	GGT	2	6	231382	231387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308567
4066	NC_019738	A	6	6	231434	231439	100 %	0 %	0 %	0 %	428308567
4067	NC_019738	GAT	2	6	231493	231498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308567
4068	NC_019738	TCC	2	6	231500	231505	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	428308567
4069	NC_019738	TAC	2	6	231511	231516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308567
4070	NC_019738	CCG	2	6	231518	231523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308567
4071	NC_019738	TTTGG	2	10	231559	231568	0 %	60 %	40 %	0 %	428308567
4072	NC_019738	GTT	2	6	231601	231606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308567
4073	NC_019738	CGG	2	6	231618	231623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	428308567
4074	NC_019738	TTA	2	6	231823	231828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308567
4075	NC_019738	ATG	2	6	231881	231886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_019738	CTG	2	6	231896	231901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_019738	TCA	2	6	231955	231960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308568
4078	NC_019738	GTTCTC	2	12	231965	231976	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428308568
4079	NC_019738	CGA	2	6	231981	231986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308568
4080	NC_019738	CTT	2	6	232007	232012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	428308568
4081	NC_019738	GAA	2	6	232022	232027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308568
4082	NC_019738	TGG	2	6	232085	232090	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308568
4083	NC_019738	ACA	2	6	232166	232171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308568
4084	NC_019738	ATA	2	6	232177	232182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308568
4085	NC_019738	CGC	2	6	232228	232233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	428308568
4086	NC_019738	AC	3	6	232259	232264	50 %	0 %	0 %	50 %	428308568
4087	NC_019738	A	6	6	232328	232333	100 %	0 %	0 %	0 %	428308568
4088	NC_019738	CAG	2	6	232424	232429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308568
4089	NC_019738	CAG	2	6	232475	232480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308568
4090	NC_019738	CAC	2	6	232485	232490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308568
4091	NC_019738	TGG	2	6	232502	232507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	428308568
4092	NC_019738	CAA	2	6	232535	232540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308568
4093	NC_019738	ACC	2	6	232546	232551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428308568
4094	NC_019738	CAG	2	6	232683	232688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308568
4095	NC_019738	GATC	2	8	232712	232719	25 %	25 %	25 %	25 %	428308568
4096	NC_019738	TAAT	2	8	232815	232822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_019738	TTG	2	6	232880	232885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308569
4098	NC_019738	GTA	2	6	232896	232901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428308569
4099	NC_019738	T	8	8	232979	232986	0 %	100 %	0 %	0 %	428308569
4100	NC_019738	CAT	2	6	232998	233003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308569
4101	NC_019738	GCT	2	6	233016	233021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_019738	AAT	2	6	233031	233036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_019738	TTG	2	6	233071	233076	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308570
4104	NC_019738	AGG	2	6	233129	233134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428308570
4105	NC_019738	TTGAT	2	10	233363	233372	20 %	60 %	20 %	0 %	428308570
4106	NC_019738	AGC	2	6	233423	233428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308570
4107	NC_019738	GCAA	2	8	233464	233471	50 %	0 %	25 %	25 %	428308571
4108	NC_019738	CAG	2	6	233551	233556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308571
4109	NC_019738	ATT	2	6	233558	233563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428308571
4110	NC_019738	GTT	2	6	233671	233676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308571
4111	NC_019738	AAACC	2	10	233721	233730	60 %	0 %	0 %	40 %	428308571
4112	NC_019738	GTT	2	6	233759	233764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308571
4113	NC_019738	CAT	2	6	233811	233816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4114	NC_019738	GT	3	6	233819	233824	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_019738	GAT	2	6	233920	233925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_019738	CAG	2	6	234014	234019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308572
4117	NC_019738	TGT	2	6	234135	234140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308572
4118	NC_019738	AAT	2	6	234147	234152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428308572
4119	NC_019738	CAA	2	6	234167	234172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428308572
4120	NC_019738	TCAT	2	8	234196	234203	25 %	50 %	0 %	25 %	428308572
4121	NC_019738	AGGA	2	8	234359	234366	50 %	0 %	50 %	0 %	428308572
4122	NC_019738	ACGACA	2	12	234460	234471	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428308572
4123	NC_019738	GTAAA	2	10	234510	234519	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4124	NC_019738	AGC	2	6	234620	234625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_019738	CA	3	6	234667	234672	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4126	NC_019738	GTT	2	6	234702	234707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_019738	CT	3	6	234714	234719	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4128	NC_019738	CAT	2	6	234725	234730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308573
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4143	NC_019738	TGT	2	6	235233	235238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428308573
4144	NC_019738	A	6	6	235255	235260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4145	NC_019738	ATTA	2	8	235322	235329	50 %	50 %	0 %	0 %	428308574
4146	NC_019738	TTAAT	2	10	235418	235427	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4147	NC_019738	CGCTA	2	10	235554	235563	20 %	20 %	20 %	40 %	428308575
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4161	NC_019738	A	6	6	236353	236358	100 %	0 %	0 %	0 %	428308575
4162	NC_019738	G	6	6	236371	236376	0 %	0 %	100 %	0 %	428308575
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4167	NC_019738	CA	5	10	236790	236799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4168	NC_019738	GCG	2	6	236873	236878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4233	NC_019738	T	6	6	240402	240407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4234	NC_019738	TCA	2	6	240413	240418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428308579
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4245	NC_019738	A	7	7	240953	240959	100 %	0 %	0 %	0 %	428308579
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4249	NC_019738	T	6	6	241273	241278	0 %	100 %	0 %	0 %	428308579
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4365	NC_019738	CCTGC	2	10	247957	247966	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4366	NC_019738	TTG	2	6	247990	247995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4373	NC_019738	GAA	2	6	248416	248421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	428308586
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4393	NC_019738	T	7	7	249639	249645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4394	NC_019738	ATC	2	6	249753	249758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4499	NC_019738	CAG	2	6	255342	255347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428308590
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